Le premier semestre est focalisé sur le renforcement des connaissances des matières de base telles la bioécologie des organismes aquatiques, les analyses mathématiques des données, les sciences sociales et l’initiation à la méthodologie de recherche. A partir du deuxième semestre, deux parcours sont proposés: le Parcours Gestion durable de la pêche et de l’aquaculture (GDPA) et le Parcours Gestion durable de la biodiversité et de l’environnement (GDBE).

Pour le Parcours GDPA, les unités d’enseignement dispensées couvrent les problèmes relatifs à l’exploitation et à la gestion de la pêche (sciences halieutiques et aquacoles, acquisition et traitement des données sur les pêches, l’économie des pêches, les outils de gestion de pêche : Evaluation des stocks, Approche écosystémique des pêches, Soutien durable aux pêcheries (les Aires Marines Protégées ou AMP).

Pour le Parcours GDBE, les matières de spécialisation couvrent les notions sur l’Ecologie appliquée, la pollution marine, la plongée sous-marine, la conservation des écosystèmes, la gestion de l’environnement et la biotechnologie marine.

Le dernier semestre est consacré à la réalisation d’ un stage de recherche et/ou professionnel d’une durée de 6mois, aboutissant à la rédaction et la soutenance d’un mémoire de fin d’étude.